Jeg er veldig usikker på kommareglene; de stemmer jo oftest ikke med det jeg ser i media/aviser.

Det er riktig at mange er usikre på og/eller slurver med kommareglene. Kommaet er et pausetegn og skal brukes når talen krever pause; men reglene er bygger allikevel på grammatisk analyse.
I svært korte trekk følger noen hovedregler du kan ta utgangspunkt i, jf. Finn-Erik Vinjes Skriveregler (9. utg.):
Mellom sideordnende setninger: «Jenta leser, og gutten skriver.»
Etter leddsetninger: «Da hun kom, gikk han.»
Foran leddsetninger som er løst tilknyttet: «Politikeren støttet forslaget, skjønt han ikke hadde satt seg inn i det.»
Ved forklarende eller presiserende tilføyelser: «Ibsen, vår berømte dikter, ble født i Skien.»
Alltid foran men: «Jeg skal hjelpe deg, men jeg har ikke noe lyst til det.»